Salut,
Il y aurait une solution

Il suffit d'avoir deux Windows dans ton PC sur deux disques durs différents.
Là tu auras deux comptes différents un sur ton premier disque dur avec toutes tes applications, et un, sur ton deuxième disque dur, avec rien dedans.
Pour être sûr que le deuxième vienne pas mettre des fichiers dans le premier, tu installes le deuxième Windows en ayant complètement enlever le premier disque dur du PC (en laissant sa place vide, ne pas y connecter le deuxième disque dur à cet endroit).
Tu installes de nouveau ton système dessus.
Une fois fini, tu remets le premier disque dur dans le PC à sa bonne place, tu relances le PC et ... ton premier Windows se lance.
Pour avoir le choix des Windows, au démarrage du PC, tu installes EasyBCD 1.7.2 (pour le trouver, google est ton ami), et tu le configures pour qu'il te rajoute le démarrage sur ton deuxième disque dur.
Et le tour est joué ...

tu n'as plus qu'à enlever les lettres des partitions de ton premier disque dur dans le second Windows et vice-versa ...
P.S. : Il y a plus simple, tu peux aussi essayer d'installer Windows sur une deuxième partition de ton disque dur mais là, il faudra que tu gardes la lettre de lecteur pour C (partition de boot) et pour l'autre partition où tu auras installé le nouveau Windows
(par nouveau windows, j'entends le deuxième Windows, pas une nouvelle version de Windows).
Bonne chance !